En la temporada 98/99 se participo en 2ª Autonómica Masculina, contándose además con dos conjuntos junior masculino y dos conjuntos cadete masculino, en esta nueva etapa el cuadro técnico, estaba formado por Manuel Fúnez, Lucas Fernández y Javier Rodríguez Lechuga.

Durante esta temporada, bajo el paraguas de la empresa de transportes GUIPUZCOANA, se volvió a competir en categoría Provincial, Junior y Cadete Masculino., disputando los encuentros y entrenamientos del club en el recién estrenado Pabellón Príncipe Juan Carlos, proclamándose bajo la dirección de Lucas Fernández el Senior Masculino CAMPEON TROFEO DIPUTACION PROVINCIAL 97/98 primer título del Club.